مصرف سیاهدانه مانند بسیاری از گیاهان دارویی به جهت ترکیبات موجود در آنها بایستی خیلی محدود و با رعایت جوانب صورت گیرد. ضمن اینکه؛ مصرف سیاهدانه در دوران شیمی درمانی، اثرات داروها را مختل میکند. و در تعداد محدودی از افراد نیز، مصرف بیش از حد این گیاه منجر به ناراحتی معده، استفراغ یا یبوست شده است.