داستان 2 Ghostrunner در ادامه وقایع نسخه اول رخ می‌دهد، جایی که قهرمان سایبرنتیکی بازی پس از سرنگونی برج دارما و شکست دادن مدیریت مستبد آن، با تهدیدات جدیدی روبرو می‌شود. در این بازی، بازیکنان با دنیای خارج از برج مواجه می‌شوند که پر از خطرات و دشمنان تازه‌ای است که قصد دارند به دستاوردهای قهرمان پایان دهند. این داستان نه تنها به کاوش در دنیای سایبرپانکی بازی ادامه می‌دهد، بلکه به عمق بیشتری از شخصیت‌ها و دنیای بازی می‌پردازد.
