چهار برادر لاکپشت که زندگی خود را صرف یادگیری نینجوتسو کرده‌اند، پس از سال‌ها پناه‌گرفتن از دنیای انسان‌ها در فاضلاب‌های شهر نیویورک، راهی سطح می‌شوند تا به عنوان نوجوانان عادی پذیرفته شوند؛ دوست جدیدشان اپریل اونیل به آنها کمک می‌کند تا با یک سندیکای جنایتکارانه و ارتشی از جهش‌یافته‌ها مقابله کنند ...
